美國賓州大學醫學院的路易斯教授發表在知名的科學期刊(science)的研究指出，腸道菌菌型不同，所喜歡的食物也不一樣，路易斯教授找來了98位健康的民眾填寫飲食問卷，並檢測這些人腸道菌的基因型，發現類桿菌屬(Bacteroides)的腸道菌喜歡典型的西方飲食，像是肉類及高脂食物，而普雷沃氏菌屬(Prevotella)則喜歡高碳水化合物的食物。
歐洲分子生物學實驗室柏克博士(Peer Bork)領軍的跨國研究團隊在自然期刊(Nature)上發表研究指出，他們觀察人體腸道菌的基因形態，發現可以明顯區分出為三個族群，並以菌落數量最多的細菌名稱來命名菌型，第一種主要是類桿菌屬(Bacteroides)為主，第二種主要是普雷沃氏菌屬(Prevotella)，第三種則是以瘤胃球菌屬(Ruminococcus)為多數。
 
1.類桿菌屬(Bacteroides)：乳酸菌(Lactobacillus)、比菲德氏菌(Bifidobacterium)、嗜鹼菌(Alkaliphilus)等。擅長分解碳水化合物，擁有這種菌型的人可能會比較不容易肥胖。
2.普雷沃氏菌屬(Prevotella)：葡萄球菌(Staphylococcus)、螺旋桿菌(Helicobacter，幽門桿菌)、霍爾德曼氏菌(Holdemania)等。會分解腸道黏液，增加腸道疼痛的機率。
3.瘤胃球菌屬(Ruminococcus)：共生小桿菌(Symbiobacterium)、葡萄球菌(Staphylococcus)等。會幫助細胞吸收糖分，這種菌型太多可能讓體重會有增加的現象。
 
腸道菌會協助人體消化及合成人體所需的維生素，像是第一種類桿菌屬會生產製作維生素B7(生物素)的酵素，第二種普雷沃氏菌屬則會生產製作維生素B1的酵素。目前尚不清楚每個人的腸道菌落為何都不相同，柏克博士發現與年齡、性別、種族和飲食習慣都與體內的菌型無關。
 
人體腸道菌落不同菌型的可能原因
1.由每個人的血型決定。
2.腸道中有三種化學反應可以去除食物在腸道中發酵時所產生的氫氣，而這三種代謝模式有可能決定了腸道菌落的主要菌型。
3.嬰兒時期，因為免疫系統尚未建全，此時隨機接觸到的菌種決定了日後腸道菌的菌型。
 
路易斯教授瞭解了98位健康的民眾飲食習慣及他們腸道菌的菌型後，更進一步想要知道改變飲食是不是會改變腸道菌的菌型，於是邀集了10個健康的民眾在醫院住了10天，5位吃高脂低纖的食物，另5位則是吃低脂高纖的食物，在24小時後檢測，發現腸道屬菌的組成菌種有改變，但10天後檢測，仍維持相同的腸道菌菌型。
 
每個人的菌種可能高達上千種，由於腸道菌很敏感，短期飲食改變就會造成腸道菌菌種的變化，如果想要改變腸道菌的菌型，可能需要花更長的時間。羅馬不是一日造成的，祝各位健康