二型的膠原蛋白又稱為N型膠原蛋白，目前所知道的關節特異性抗原存在於關節軟骨中，包括膠原蛋白第二型(CII )、第九型(CIX)、第十一型(CXI) 和非膠原性蛋白質如aggrecan 和cartilage oligmeric protein(COMP)。其中膠原蛋白第二型的CII、第九型的CIX和aggrecan己知可於動物模式中誘發關節炎，其中又以第二型的CII最被廣泛使用。

第二型的膠原蛋白CⅡ亦是軟骨中存在量最多的蛋白質。第二型的膠原蛋白CII顯示在類風濕關節炎(rheumatoid arthritis , RA)上的病原角色，例如自身性第二型的膠原蛋白CII自體抗體可在RA 病患的血清、滑膜液(synoval fluid)和軟骨中被發現，甚至從RA 病患血清中分離得到第二型的膠原蛋白CII抗體。顯示CII是一個主要的自體免疫成分

1993年哈佛大學David E. Trentham於「科學」雜誌(Science)發表嚴重類風溼性關節炎患者(60位)在使用雞二型膠原蛋白三個月後，竟可以顯著改善雞的症狀與嚴重度，而且無任何副作用，開啟了使用二型膠原用於類風溼性關節炎的輔助療法上。這樣的作用機轉就是免疫學上為人熟知之口服免疫耐受作用（Oral Tolerization），吸收過程為二型膠原蛋白經過胃，被小腸淋巴(Peyer’s Patches)識別後，使免疫系統產生"耐受"認同作用，直達軟骨組織，快速修復軟骨，消除關節的疼痛、腫脹、僵硬、無力感、有響聲、骨質增生、骨刺、五十肩、網球肘等。